2009年，理论及计算光化学教育部重点实验室成立。

1月15日，根据教育部下发的《关于公布北京师范大学等87所普通高等学校本科教学工作水平评估结论的通知》，我校获得“优秀”成绩。9月，我院王科志教授主持的“化学综合实验”入选2009年度北京市精品课程。12月，我院欧阳津教授获得2009年宝钢优秀教师奖。12月，王科志教授主持的“无机化学精品教材建设”入选北京高等教育精品教材建设立项项目。本年度，“双语基础有机化学”被评选为2009年度国家级双语教学示范课程。6月，在第五届“挑战杯”首都大学生课外学术科技作品竞赛中，刘珵、董威红、刘淼的作品“C60空心纳米壳的制备及应用研究”获得特等奖。11月，在第十一届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛中，我院2006级本科生刘珵、董威红、刘淼组成的科研团队获得二等奖。

4月6日，化学学院第一届教职工代表大会在化学楼二楼会议室召开并取得圆满成功，校党委副书记、校工会主席、校教代会执委会主任王炳林，副校长陈光巨，校工会常务副主席、校教代会执委会副主任丛玲，校工会副主席成国志，校教代会执委会副主任刘永平以及部分院系工会主席出席会议。化学学院23位教职工代表和2位列席代表参加了会议。会议在雄壮的国歌声中开幕，王炳林副书记代表学校党委发表重要讲话，并对化学学院教代会提出几点希望。会上，审议了方维海院长所作的工作报告、工会主席何兰同志的院工会工作报告和副院长贾海顺同志的院财务工作报告。院分党委副书记张俊波主持了第一届教代会执委会的选举工作，门毅、方德彩、刘远霞、成莹、何兰、杨晓晶、秦卫东当选为院第一届教代会执委会委员，杨晓晶同志为执委会主任，何兰同志为执委会副主任。

中国核学会2009年学术年会于 2009年11月18—20日在北京国家会议中心隆重召开，来自我国核工业、核基础科学、核应用技术领域的44位院士和1100多名代表参加了会议。放射性药物教育部重点实验室博士生张仕坚、牟甜甜等的研究论文从参会的1706篇文章中脱颖而出，分别荣获中国核学会2009年学术年会优秀论文一等奖和青年优秀科技论文奖，张仕坚博士还作了会议口头报告。